细胞破壁机的工作原理，在磨筒（粉碎室）中装填一定数量的研磨介质，如硬质材料的球、棒或柱，磨筒在外加激振力的作用下产生的顺逆时针方向的圆振动。磨筒的强烈振动使磨筒内介质产生抛掷运动，在此抛掷运动的作用下，使每个介质都产生了与圆振动同向的旋转运动，与此同时，介质群也产生3-5周与圆振动反向的低频公转运动。

  细胞破壁机维护方便，结构紧凑，占地面积小，维修养护方便。改善环境，全密闭作业无粉尘溢出、有效成份不损失、无药渣产生，可改善工作环境。提率：粉碎，无药渣。高速撞击力和剪切力的双向作用，极大地缩短了粉碎时间，提高粉碎效率。广谱适应，对于任何纤维状、高韧性、高硬度或有一定含水率的物料均可适应。对花粉及其它孢子植物等要求打破细胞壁的物料，其破壁率高于95%。同时适应干式和湿式粉碎。湿式粉碎时可加入水、酒精或其它液体。温度可控：通过配置可进行高温、常温、低温或超低温的微粉碎，可以保持物料的原有理化性质和活性成份。给磨筒外壁的夹套通入冷水。通过调节冷却水的温度和流量可控制粉碎温度。低温粉碎，冷冻系统最低温度可达零下35℃（高档低温配置）。

  细胞破壁机对任何纤维状、高韧性、高硬度或有一定含水率的物料均可进行有效粉碎，特别适用于中药细胞破壁等旨在提高药物生物利用度的粉碎要求及用常规方法无法达到要求细度的物料。中药细胞破壁机除应用在生物制药、天然（保健）食品和化妆品外，还广泛应用于建材（制备超细水渣、粉煤灰等）、化工、冶金、环保（垃圾微粉制砖等）、电子（桨料、石墨乳等）等与粉体应用有关的各种行业。